信義宗神學院是由基督教香港信義會、中華基督教禮賢會香港區會、基督教香港崇真會及基督教台灣信義會四間教會於1977年7月1日聯合建立，並在同年9月3日舉行了首次開學禮。

本院具有歷史悠久的背景和深厚的神學傳統。本院前身為譽滿東南亞的信義神學院。該院於1913年創建於中國湖北灄口（漢口附近），屬中華信義會。1948年底，該院因大陸時局動盪而遷來香港，成為基督教香港信義會之神學教育機構。前後64年，信義神學院為華人教會培育了數以百計的全職牧者和數以千位信徒領袖；於供應人材、保存純正信仰，發展本色神學和推進教會合作上，貢獻良多。自1972年起，該院董事會鑑於神學教育必須群策群力，決定不惜代價，聯繫有關教會以達成合作。1976年5月8日，在聖靈引導下，基督教香港信義會、中華基督教禮賢會香港區會及基督教香港崇真會的代表簽署協議，決定創辦一所信義宗的聯合神學院，試辦五年。翌年，基督教台灣信義會決定加入。為使本院順利建立，信義神學院遂於1977年6月底自動停辦。1982年，信義宗神學院試辦期滿，上述四間成員教會一致同意繼續合作，聯合主辦本院。

本院不獨人才、設備、經驗等各方面繼承了基督教香港信義會及前信義神學院之豐富資源，也繼承了其他成員教會在神學教育事工上之豐富遺產。中華基督教禮賢會香港區會曾在大陸有多年辦聖經學校和神學院的經驗；基督教台灣信義會也曾在五六十年代，先後在台灣開設聖經學院及頗具規模的中華信義神學院；而基督教香港崇真會於1846年創設之存真書院（樂育神學院前身）更為史家公認為中國第一所正式的神學院。

1992年末，為發展所需，信義宗神學院遷往道風山山頂新校舍。這項建校工作始於1985年的「信心之旅」；世界各地及香港信徒在經濟及祈禱上均提供了支持。這座 被譽為第三世界中其中一座最美麗的神學校園具有傳統中國風格，也飾以不少原創的藝術品。它不但是一座瑰麗之建築物，更是祈禱、崇拜及學習的理想場所。遷校的過程再次印證了本地和國際合作的重要性，因此，我們更積極地尋求與不同地區的信義宗教會、各宗派和教會機構合作。

在香港，本院主動與不同的教會分享異象，邀請他們成為會員。港澳信義會於1993年成為會員教會，而香港基督教循道衛理聯合教會則成為友誼會員。1996年香港路德會不單加入作友誼會員，更在神學教育上合作，差派教授到本院任教和保送學生就讀。同年，港澳信義會鑑於信徒領袖培訓的重要，讓我們使用位於九龍的錫安樓物業作為本院的延伸課程中心。1997年，粵南信義會也加入成為會員教會。這些教會的資源和經驗幫助我們完成使命、鞏固神學教育基礎，並預備未來的發展。

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